Uitverkoop!

Illumina MiSeq Sequencer DNA System - Afbeelding 2

Illumina MiSeq Sequencer DNA System - Afbeelding 3

Illumina MiSeq Sequencer DNA System - Afbeelding 4

Illumina MiSeq Sequencer DNA Systeem

Name: Illumina MiSeq Sequencer DNA Systeem
Brand: DNA & RNA Zuivering
SKU: MiSeq
Availability: InStock
Rating: 5 (1 reviews)

Oorspronkelijke prijs was: $33,999.00.Huidige prijs is: $23,999.00.

Illumina MiSeq is het eerste DNA-naar-data sequencingplatform dat clustering en amplificatie mogelijk maakt, wat hoge flexibiliteit en gemakkelijke toegang biedt voor kleinere projecten zoals gerichte re-sequencing.

Op voorraad

Artikelnummer: MiSeq Categorie: DNA & RNA Zuivering Tag: Illumina MiSeq

Beschrijving
Beoordelingen (0)

Illumina MiSeq is het eerste DNA-naar-data-sequencingplatform waarmee clustering, amplificatie, sequencing en data-analyse in één enkel apparaat kunnen worden uitgevoerd. Dankzij de kleine voetafdruk (ca. 0,19 vierkante meter) is het systeem geschikt voor vrijwel elke laboratoriumomgeving. Het MiSeq-systeem maakt gebruik van SBS-chemie (Sequencing by Synthesis, sequencen door synthese) van Illumina, een beproefde NGS-sequencingtechnologie (Next Generation Sequencing, sequencen van de volgende generatie), waarmee meer dan 90% van 's werelds sequencinggegevens wordt gegenereerd.

Met het MiSeq System heeft u toegang tot gerichte toepassingen zoals targeted resequencing, metagenomics, sequencing van kleine genomen, targeted genexpressieprofilering, en meer. MiSeq reagentia maken tot 15 Gb aan output mogelijk met 25 miljoen sequencing reads, en twee × 300 bp read lengtes. Het MiSeq systeem is ideaal voor snelle en goedkope genetische analyse met NGS-prestaties en compacte afmetingen.

De Illumina MiSeq is een krachtig en compact next-generation sequencing (NGS) platform dat ideaal is voor een breed scala aan toepassingen, waaronder genoomsequencing van kleine organismen, exoomsequencing, ampliconsequencing en metagenomica.

Next-generation sequencingapparaat voor veel low- tot medium throughput toepassingen, bv. paneelsequencing, genoomsequencing van bacteriële genomen, microbioomanalyses, kleine transcriptomen. De MiSeq is een geïntegreerd instrument dat clonale amplificatie, genomische DNA-sequencing en data-analyse met base calling, alignment, variant calling en rapportage uitvoert in één run.

Het MiSeq benchtop instrument maakt gebruik van een dubbelzijdige flowcel met één baan en een reagenscartridge die als kit worden geleverd. Sequencen wordt uitgevoerd door de synthese van DNA-strengen in clusters van op de flowcel aangebrachte voorbeeldtemplates vast te leggen.

Belangrijkste Kenmerken

Snelle, gemultiplexte 16S ampliconsequencing
Nextera Bibliotheekpreparaat voor het MiSeq Systeem
Sequencing Library QC op het MiSeq-systeem
Hogesnelheids, Gemultiplexte Microbiële Sequentiëring op het MiSeq Systeem
Hoogwaardige, paired-end reads zorgen voor superieure de novo genoomassemblage

Het verschil tussen Illumina MiSeq en HiSeq ligt voornamelijk in hun capaciteit, uitvoer en toepassingen.Illumina MiSeq:* Capaciteit en uitvoer: De MiSeq is ontworpen voor een lagere doorvoer en is ideaal voor kleinere projecten en snelle resultaten. Het is geschikt voor het sequencen van enkele genen, kleine genomen, exoomsequencing, 16S rRNA-sequencing en amplicon-sequencing. * Prijs: Over het algemeen is de MiSeq betaalbaarder in aanschaf en gebruik dan de HiSeq, waardoor het een uitstekende keuze is voor kleinere laboratoria of specifieke, beperkte projecten. * Gebruiksgemak: De MiSeq wordt vaak geprezen om zijn gebruiksgemak. Het is een benchtop-systeem dat relatief eenvoudig te bedienen is, zelfs voor gebruikers met minder ervaring. * Toepassingen: Medische diagnostiek, microbiële genomica, kleine onderzoeksprojecten.Illumina HiSeq:* Capaciteit en uitvoer: De HiSeq-serie (waaronder modellen zoals HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000) is ontworpen voor een veel hogere doorvoer. Het is geschikt voor grootschalige projecten zoals het sequencen van gehele genomen, transcriptoomsequencing (RNA-Seq) van meerdere monsters, epigenomica en populatiegenomica. * Prijs: De HiSeq-systemen zijn aanzienlijk duurder in aanschaf en onderhoud vanwege hun hogere capaciteit en complexiteit. * Gebruiksgemak: De HiSeq-systemen kunnen complexer zijn in bediening en vereisen meer gespecialiseerde training en infrastructuur. * Toepassingen: Grootschalige genomische onderzoeksprojecten, dier- en plantengenomica, grote klinische studies.Samengevat:* `MiSeq` is voor kleinere projecten met lagere doorvoer en snelle resultaten (bv. enkele genen, kleine genomen). * `HiSeq` is voor grootschalige projecten met hoge doorvoer (bv. hele genomen, grote studies).De keuze tussen MiSeq en HiSeq hangt af van de specifieke onderzoeksvraag, het budget, de benodigde doorvoer en de beschikbare expertise.

De HiSeq- en MiSeq-platforms verschillen aanzienlijk in schaal. De HiSeq2000 produceert >50 Gb per dag, en produceert gedurende een run van 10,8 dagen 1,6 miljard 100-base paired-end reads. De MiSeq daarentegen is bedoeld voor experimenten van één dag en genereert 1,5 Gb per dag van 5 miljoen 150-base paired-end reads.

Eenvoudige, intuïtieve NGS-workflow

Het MiSeq System biedt eenvoudige, gemakkelijk te volgen software voor instrumentbeheer. Voer instrumentoperaties uit met een intuïtieve touchscreeninterface, gebruik plug-and-play reagentiecartridges met radiofrequentie-identificatie (RFID)-tracking, raadpleeg video-tutorials op het scherm en geniet van stapsgewijze begeleiding gedurende elke sequencing workflow.

Alle MiSeq-systemen zijn uitgerust met ingebouwde data-analyse en toegang tot BaseSpace™ Sequence Hub, het cloud-computingplatform voor genomica van Illumina. BaseSpace Sequence Hub biedt real-time data-upload, eenvoudige tools voor data-analyse, internetgebaseerd run-monitoring en een veilige, schaalbare opslagoplossing. Een reeks data-analyse tools en een groeiend aantal analyse-apps van derden stellen gebruikers in staat.

Specificaties

MiSeq biedt korte sequentietijden en lange leeslengtes met behoud van hoge datakwaliteit.

	MiSeq Reagent Kit v2				MiSeq Reagent Kit v3
Leeslengte	Eén × 36 bp	Twee × 25 bp	Twee × 150 bp	2 × 250 bp	2 keer 75 bp	2 × 300 bp
Totale tijd*	~4 uur	~5,5 uur	~24 uur	~39 uur	~21 uur	~56 uur
Uitvoer	540–610 Mb	750–850 Mb	4,5–5,1 Gb	7,5–8,5 Gb	3,3–3,8 Gb	13,2–15 GB

	MiSeq Reagent Kit v2 Micro	MiSeq Reagent Kit v2 Nano
Leeslengte	2 × 150 bp	2 × 250 bp	2 × 150 bp
Totale tijd*	ongeveer 19 uur	~28 uur	ongeveer 17 uur
Uitvoer	1,2 GB	500 MB	300 Mb

Totale tijd omvat clustergeneratie, sequencing en base calling op een MiSeq-systeem met dual-surface scanning.

	MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3	MiSeq Reagent Kit v2 Micro	MiSeq Reagent Kit v2 Nano
Enkele Lezingen	12-15 miljoen	22–25 miljoen	4 miljoen	1 miljoen
Paired-End Reads	24–30 miljoen	44–50 miljoen	8 miljoen	2 miljoen

Installatiespecificaties op basis van de Illumina PhiX controlebibliotheek bij ondersteunde clusterdichtheden (865-965 k/mm²)² clusters voldoen aan filter voor v2 chemie en 1200-1400 k/mm² clusters die de filter passeerden voor v3-chemie). Werkelijke prestatieparameters kunnen variëren, afhankelijk van het monstertype, de monsterkwaliteit en het aantal clusters dat de filter passeert.

MiSeq Reagent Kit v2	MiSeq Reagent Kit v3
> 90%-basen hoger dan Q30 bij 1 × 36 bp	> 85%-basen hoger dan Q30 bij 2 × 75 bp
> 90%-basen hoger dan Q30 bij 2 × 25 bp	> 70%-basen hoger dan Q30 bij 2 × 300 bp
> 80%-basen hoger dan Q30 bij 2 × 150 bp
> 75%-basen hoger dan Q30 bij 2 × 250 bp

† Een kwaliteitsgetal (Q-score) voorspelt de kans op een fout bij het basenroepen. Het percentage basen > Q30 wordt gemiddeld over de gehele run.

Een vooronderzoek naar het potentieel van Nanopore MinION en Illumina MiSeq 16S rRNA-genensequencing

Zowel short-read amplicons gesequenced met Illumina MiSeq als long-read amplicons gesequenced met Nanopore MinION werden taxonomisch toegewezen aan de GG- en SILVA-databases. De verkregen microbiële classificaties werden vergeleken op verschillende taxonomische niveaus (orde, familie, geslacht en soort) voor alle 12 monsters.

Illumina-MiSeq-heatmap

Inclusief:

Installatie- en Operationele Kwalificatie
Wegwerp Wasbuizen
MiSeq Reagent Kit v3 (150-cycli)
MiSeq Reagent Kit v3 (600 cycli)
TG MiSeq Reagent Kit v3 (600 cycli)
TG MiSeq® Reagent Kit v3 (150 cycli)
Reagenskit v2 (50 cycli)
Reagenskit v2 (300 cycli)
Reagens Kit v2 (500 cycli)
OEM-installatie en preventief onderhoud zijn uitgevoerd.
De machine wordt uitgeschakeld wanneer deze niet in gebruik is. Wasbeurten worden maandelijks uitgevoerd. Alle software inbegrepen.