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Illumina MiSeq Sequencer DNA System – Image 2

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Système d'ADN Illumina MiSeq Sequencer

Name: Système d'ADN Illumina MiSeq Sequencer
Brand: Purification de l'ADN et de l'ARN
SKU: MiSeq
Availability: InStock
Rating: 5 (1 reviews)

Le prix initial était de : $33,999.00.Le prix actuel est de : $23,999.00.

Illumina MiSeq est la première plateforme de séquençage ADN-données qui permet le regroupement, l'amplification, avec une grande flexibilité et un accès facile pour les petits projets tels que le re-séquençage ciblé.

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UGS : MiSeq Catégorie : Purification de l'ADN et de l'ARN Étiquette : Illumina MiSeq

Description
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Illumina MiSeq Il s'agit de la première plateforme de séquençage ADN-à-données qui permet le regroupement, l'amplification, le séquençage et l'analyse des données au sein d'un seul et même appareil. Grâce à son faible encombrement (environ 0,19 m²), le système s'adapte à pratiquement tous les environnements de laboratoire. Le système MiSeq utilise la chimie SBS (Sequencing by Synthesis, séquençage par synthèse) d'Illumina, une technologie de séquençage NGS (Next Generation Sequencing, séquençage de nouvelle génération) éprouvée, grâce à laquelle plus de 90% des données de séquençage mondiales sont générées.

Avec le système MiSeq, vous pouvez accéder à des applications ciblées telles que le re-séquençage ciblé, la métagénomique, le séquençage de petits génomes, le profilage de l'expression génique ciblé, et plus encore. Les réactifs MiSeq permettent un rendement allant jusqu'à 15 Gb avec 25 millions de lectures de séquençage, et des longueurs de lecture de deux × 300 paires de bases. Le système MiSeq est idéal pour une analyse génétique rapide et peu coûteuse avec des performances NGS et des dimensions compactes.

Qu'est-ce que Illumina MiSeq ?

Séquenceur nouvelle génération pour de nombreuses applications à faible et moyen débit, par exemple, séquençage de panels, séquençage de génomes bactériens, analyses de microbiomes, petits transcriptomes. Le MiSeq est un instrument intégré qui effectue l'amplification clonale, le séquençage de l'ADN génomique et l'analyse des données avec appel des bases, alignement, appel des variants et génération de rapports en une seule course.

L'instrument de paillasse MiSeq utilise une cellule de flux à simple voie et double face ainsi qu'une cartouche de réactifs fournis en kit. Le séquençage est effectué en enregistrant la synthèse des brins d'ADN dans des amas d'échantillons à amorce fixés à la cellule de flux.

Caractéristiques clés

Séquençage d'amplicons 16S à haute vitesse et multiplexé
Préparation de librairies Nextera pour le système MiSeq
Contrôle qualité de la librairie de séquençage sur le système MiSeq
Séquençage microbien à haute vitesse et multiplexé sur le système MiSeq
Des lectures appariées et de haute qualité assurent un assemblage de novo du génome supérieur

Quelle est la différence entre Illumina MiSeq et HiSeq ?

Les plateformes HiSeq et MiSeq diffèrent considérablement par leur échelle. La Le HiSeq2000 produit plus de 50 Go par jour, et au cours d'une course de 10,8 jours, produit 1,6 milliard de lectures double appariées sur 100 bases. En revanche, le MiSeq est utilisé pour des expériences d'une journée et génère 1,5 Go par jour à partir de 5 millions de lectures double appariées sur 150 bases.

Flux de travail SNG simple et intuitif

Le système MiSeq offre un logiciel de contrôle d'instrument simple et facile à utiliser. Effectuez les opérations de l'instrument avec une interface intuitive à écran tactile, utilisez des cartouches de réactifs « plug-and-play » avec suivi par identification par radiofréquence (RFID), consultez des tutoriels vidéo à l'écran et bénéficiez d'instructions étape par étape tout au long du flux de travail de séquençage.

Tous les systèmes MiSeq incluent une analyse de données intégrée et l'accès à BaseSpace™ Sequence Hub, la plateforme de cloud computing génomique d'Illumina. BaseSpace Sequence Hub offre le téléchargement de données en temps réel, des outils d'analyse de données simples, la surveillance des séquençages sur Internet et une solution de stockage sécurisée et évolutive. Une suite d'outils d'analyse de données et une liste croissante d'applications d'analyse tierces permettent.

Spécifications

MiSeq offre des temps de séquençage courts et des longueurs de lecture longues tout en maintenant une haute qualité de données.

	Kit de réactifs MiSeq v2				Kit de réactifs MiSeq v3
Longueur de lecture	Un × 36 pb	2 × 25 p.n.	Deux × 150 pb	2 × 250 paires de bases	2 × 75 pc	2 × 300 paires de bases
Temps total*	~4 heures	~5,5 heures	~24 heures	Environ 39 heures	~21 heures	environ 56 heures
Sortie	540–610 Mo	750–850 Mo	4,5–5,1 Gb	7,5–8,5 Go	3,3–3,8 Go	13,2-15 Gb

	Kit de réactifs MiSeq v2 Micro	Kit de réactifs MiSeq v2 Nano
Longueur de lecture	2 × 150 paires de bases	2 × 250 paires de bases	2 × 150 paires de bases
Temps total*	~19 heures	~28 heures	~17 heures
Sortie	1,2 Go	500 Mo	300 Mo

* Le temps total inclut la génération du cluster, le séquençage et l'appel de bases sur un système MiSeq équipé du balayage double surface.

	Kit de réactifs MiSeq v2	Kit de réactifs MiSeq v3	Kit de réactifs MiSeq v2 Micro	Kit de réactifs MiSeq v2 Nano
Lectures uniques	12 à 15 millions	22–25 millions	4 millions	1 million
Lectures Appariées	24–30 millions	44–50 millions	8 millions	2 millions

Spécifications d'installation basées sur la bibliothèque de contrôle Illumina PhiX à des densités de cluster prises en charge (865-965 k/mm²)² grappes passant le filtre pour la chimie v2 et 1200-1400 K/mm² (clusters passant le filtre pour la chimie v3). Les paramètres de performance réels peuvent varier en fonction du type d'échantillon, de la qualité de l'échantillon et des clusters passant le filtre.

Kit de réactifs MiSeq v2	Kit de réactifs MiSeq v3
> 90% présente un nombre de bases supérieur à celui du Q30 à un espacement de 36 pb	> 851 bases TP3T de plus que Q30 à 2 × 75 pb
> 90% présente un nombre de bases supérieur à celui du Q30 pour une taille de 2 × 25 pb	> 70% présente un nombre de bases supérieur à celui du Q30 à une résolution de 2 × 300 pb
> 80% : nombre de bases supérieur à celui du Q30 à une résolution de 2 × 150 pb
> 751 paires de bases TP3T de plus que le Q30 à une résolution de 2 × 250 pb

Un score de qualité (Q-score) prédit la probabilité d'une erreur dans le séquençage des bases. Le pourcentage de bases > Q30 est calculé en moyenne sur l'ensemble de la course.

Une étude préliminaire sur le potentiel du séquençage du gène ARNr 16S par Nanopore MinION et Illumina MiSeq

Les amplicons à lecture courte séquencés par Illumina MiSeq et les amplicons à lecture longue séquencés par Nanopore MinION ont été assignés taxonomiquement aux bases de données GG et SILVA. Les classifications microbiennes obtenues ont été comparées à différents niveaux taxonomiques (ordre, famille, genre et espèce) pour les 12 échantillons.

Illumina-MiSeq-carte thermique

Inclure :

Qualification d'Installation et d'Exploitation
Tubes de lavage jetables
Kit de réactifs MiSeq v3 (150 cycles)
Kit de réactifs MiSeq v3 (600 cycles)
Kit de réactifs TG MiSeq v3 (600 cycles)
Kit de réactifs TG MiSeq® v3 (150 cycles)
Kit de réactifs v2 (50 cycles)
Kit de réactifs v2 (300 cycles)
Kit de réactifs v2 (500 cycles)
L'installation OEM et la maintenance préventive ont été effectuées.
La machine est mise hors tension lorsqu'elle n'est pas utilisée. Les lavages sont effectués mensuellement. Tous les logiciels sont inclus.