Illumina MiSeq ist die erste Sequenzierungsplattform, die Clusterbildung, Amplifikation, Sequenzierung und Datenanalyse in einem einzigen Gerät vereint. Dank der geringen Stellfläche (ca. 0,19 Quadratmeter) eignet sich das System für nahezu jede Laborumgebung. Das MiSeq-System nutzt die SBS-Chemie (Sequencing by Synthesis, Sequenzierung durch Synthese) von Illumina, eine bewährte NGS-Sequenzierungstechnologie (Next Generation Sequencing, Sequenzierung der nächsten Generation), mit der mehr als 90% der weltweiten Sequenzierungsdaten generiert werden.
Mit dem MiSeq System haben Sie Zugriff auf spezielle Anwendungen wie gezielte Resequenzierung, Metagenomik, Sequenzierung kleiner Genome, gezielte Genexpressionsprofilierung und mehr. MiSeq-Reagenzien ermöglichen einen Output von bis zu 15 Gb mit 25 Millionen Sequenzierungs-Reads und einer Leselänge von 2 x 300 bp. Das MiSeq-System ist ideal für schnelle und kostengünstige genetische Analysen mit NGS-Leistung und kompakten Abmessungen.
Was ist Illumina MiSeq?
Sequenzierungsgerät der nächsten Generation für viele Anwendungen mit geringem bis mittlerem Durchsatz, z. B. Panel-Sequenzierung, Genomsequenzierung bakterieller Genome, Mikrobiom-Analysen, kleine Transkriptome. Das MiSeq ist ein integriertes Instrument, das in einem einzigen Durchlauf klonale Amplifikation, genomische DNA-Sequenzierung und Datenanalyse mit Basenidentifizierung, Alignment, Variantenidentifizierung und Berichterstattung durchführt.
Das MiSeq Desktop-Instrument verwendet eine beidseitige Flow-Zelle mit einer Lane und eine Reagenzienkassette, die als Kit geliefert werden. Die Sequenzierung erfolgt durch Aufzeichnung der Synthese von DNA-Strängen in Clustern von Proben-Templates, die an der Flow-Zelle angebracht sind.
Hauptmerkmale
- Hochgeschwindigkeits-Multiplex-Sequenzierung von 16S-Amplikons
- Nextera-Bibliotheksvorbereitung für das MiSeq-System
- Sequenzierungsbibliotheks-QC auf dem MiSeq-System
- Hochgeschwindigkeits-Multiplex-Sequenzierung von Mikroben auf dem MiSeq-System
- Hochwertige, gepaarte End-Reads gewährleisten eine überlegene De-novo-Genomassemblierung
Was ist der Unterschied zwischen Illumina MiSeq und HiSeq?
Einfacher, intuitiver NGS-Workflow

Technische Daten
MiSeq bietet kurze Sequenzierungs-Laufzeiten und lange Leselängen bei gleichbleibend hoher Datenqualität.
Cluster-Generierung und Sequenzierung
| MiSeq Reagenzkits v2 | MiSeq Reagenzkit v3 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Leselänge | Eins × 36 bp | Zwei × 25 bp | Zwei × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 75 bp | 2 × 300 bp |
| Gesamtzeit* | ca. 4 Std. | ~5,5 Std. | ~24 Std | ~39 Std | ~21 Std. | ~56 Std |
| Ausgabe | 540–610 MB | 750–850 MB | 4,5–5,1 Gbit | 7,5–8,5 Gb | 3,3–3,8 Gb | 13,2–15 Gb |
| MiSeq Reagenzkit v2 Micro | MiSeq Reagent Kit v2 Nano | ||
|---|---|---|---|
| Leselänge | 2 × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 150 bp |
| Gesamtzeit* | ~19 Std. | ~28 Std. | ~17 Std. |
| Ausgabe | 1,2 GB | 500 MB | 300 MB |
Gesamtzeit beinhaltet Clustererzeugung, Sequenzierung und Base Calling auf einem MiSeq System mit Dual-Surface-Scanning.
Filter wird gelesen**
| MiSeq Reagenzkits v2 | MiSeq Reagenzkit v3 | MiSeq Reagenzkit v2 Micro | MiSeq Reagent Kit v2 Nano | |
|---|---|---|---|---|
| Einzelne Lesevorgänge | 12-15 Millionen | 22–25 Millionen | 4 Millionen | 1 Million |
| Paired-End-Reads | 24–30 Millionen | 44–50 Millionen | 8 Millionen | 2 Millionen |
Installationsspezifikationen basierend auf der Illumina PhiX-Kontrollbibliothek bei unterstützten Clusterdichten (865–965 k/mm²).2 Cluster, die den Filter für V2-Chemie und 1200-1400 K/mm passieren2 Cluster, die den Filter für die V3-Chemie passieren. Die tatsächlichen Leistungsparameter können je nach Probentyp, Probenqualität und gefilterten Clustern variieren.
Qualitätsbewertungen†
| MiSeq Reagenzkits v2 | MiSeq Reagenzkit v3 |
|---|---|
| > 90%-Basen, die höher liegen als Q30 bei 1 × 36 bp | > 85%-Basen, die bei 2 × 75 bp höher liegen als Q30 |
| > 90%-Basen, die höher liegen als Q30 bei 2 × 25 bp | > 70%-Basen, die höher liegen als Q30 bei 2 × 300 bp |
| > 80%-Basen, die höher liegen als Q30 bei 2 × 150 bp | |
| > 75%-Basen, die bei 2 × 250 bp höher liegen als Q30 |
† Ein Qualitätswert (Q-Wert) sagt die Wahrscheinlichkeit eines Fehlers bei der Basen-Identifizierung voraus. Der Prozentsatz der Basen > Q30 wird über den gesamten Lauf gemittelt.
Eine Pilotstudie zum Potenzial der Nanopore MinION und Illumina MiSeq 16S rRNA-Gen-Sequenzierung
Sowohl Kurzlese-Amplikons, sequenziert mit Illumina MiSeq, als auch Langlese-Amplikons, sequenziert mit Nanopore MinION, wurden gegen die GG- und SILVA-Datenbanken taxonomisch zugeordnet. Die erhaltenen mikrobiellen Klassifikationen wurden auf verschiedenen taxonomischen Ebenen (Ordnung, Familie, Gattung und Art) für alle 12 Proben verglichen.

Einfügen:
- Installations- und Betriebsqualifizierung
- Einweg-Waschschläuche
- MiSeq Reagenzkit v3 (150 Zyklen)
- MiSeq Reagenzien-Kit v3 (600 Zyklen)
- TG MiSeq Reagenzien-Kit v3 (600 Zyklen)
- TG MiSeq® Reagenzkit v3 (150 Zyklen)
- Reagenz-Kit v2 (50 Zyklen)
- Reagenzkit v2 (300 Zyklen)
- Reagenzien-Kit v2 (500 Zyklen)
- OEM-Installation und vorbeugende Wartung wurden durchgeführt.
- Die Maschine wird bei Nichtgebrauch abgeschaltet. Waschvorgänge werden monatlich durchgeführt. Alle Software inklusive.
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