イルミナ MiSeq これは、クラスタリング、増幅、シーケンシング、データ解析を単一の装置で実現する、初の「DNAからデータまで」をカバーするシーケンシングプラットフォームです。 設置面積が約0.19平方メートルとコンパクトなため、本システムは事実上あらゆる実験室環境に適しています。MiSeqシステムは、実績ある次世代シーケンシング(NGS)技術であるイルミナ社のSBS(Sequencing by Synthesis)法を採用しており、世界中のシーケンシングデータの90%以上が本技術によって生成されています。.
MiSeqシステムでは、ターゲットリシーケンシング、メタゲノミクス、小ゲノムシーケンシング、ターゲット遺伝子発現プロファイリングなどの特化されたアプリケーションにアクセスできます。MiSeq試薬により、2500万リード、2×300 bpのリード長で最大15 Gbの出力が可能です。MiSeqシステムは、NGSパフォーマンスとコンパクトな寸法により、迅速かつ安価な遺伝子解析に最適です。.
Illumina MiSeqとは何ですか?
少数の低〜中スループットアプリケーション(パネルシーケンス、細菌ゲノムのゲノムシーケンス、マイクロバイオーム解析、小規模トランスクリプトームなど)に対応する次世代シーケンサー。MiSeqは、クローン増幅、ゲノムDNAシーケンス、およびベースコール、アラインメント、バリアントコール、レポーティングを含むデータ解析を単一のランで実行する統合型装置です。.
MiSeqベンチトップ型機器は、ダブルサイド(両面)、シングルレーンのフローセルと、キットとして供給される試薬カートリッジを使用します。シーケンスは、フローセルに結合されたサンプルテンプレートのクラスターにおけるDNA鎖合成の記録によって行われます。.
主な特長
- 高速・多重化16Sアンプリコンシーケンシング
- MiSeqシステム用Nexteraライブラリ調製
- MiSeqシステムでのシーケンスライブラリQC
- MiSeqシステムによる高速、多重微生物シーケンシング
- 高品質なペアエンドリードは、優れたデノボゲノムアセンブリを保証します
Illumina MiSeqとHiSeqの違いは何ですか?
シンプルで直感的な次世代シーケンシングワークフロー

仕様
MiSeqは、短いシーケンス実行時間と長いリード長、そして高いデータ品質を両立しています。.
クラスター生成とシーケンシング
| MiSeq試薬キット v2 | MiSeq試薬キット v3 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 読み取り長 | 1 x 36 bp | 2 × 25 bp | 2 × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 75 bp | 2 × 300 bp |
| 合計時間* | 約4時間 | 約5.5時間 | 約24時間 | 約39時間 | 約21時間 | 約56時間 |
| 出力 | 540~610メガバイト | 750~850MB | 4.5–5.1 Gb | 7.5~8.5ギガバイト | 3.3~3.8ギガ | 13.2~15ギガバイト |
| MiSeq試薬キット v2 Micro | MiSeq試薬キットv2 Nano | ||
|---|---|---|---|
| 読み取り長 | 2 × 150 bp | 2 × 250 bp | 2 × 150 bp |
| 合計時間* | 約19時間 | 約28時間 | 約17時間 |
| 出力 | 1.2 ギガバイト | 500メガバイト | 300メガバイト |
総時間は、デュアルサーフェススキャン対応のMiSeqシステムでのクラスター生成、シーケンシング、およびベースコールを含みます。.
フィルターを通過した読み出し**
| MiSeq試薬キット v2 | MiSeq試薬キット v3 | MiSeq試薬キット v2 Micro | MiSeq試薬キットv2 Nano | |
|---|---|---|---|---|
| シングルリード | 1200万から1500万 | 2200万~2500万 | 400万 | 100万 |
| ペアエンドリード | 2400万~3000万 | 4400万~5000万 | 800万 | 200万 |
Illumina PhiXコントロールライブラリに基づいた、サポートされているクラスター密度(865-965 k/mm)でのインストール仕様2 v2化学および1200-1400 k/mmのフィルターを通過したクラスター2 v3化学でフィルターを通過したクラスター)。実際のパフォーマンスパラメータは、サンプルタイプ、サンプル品質、およびフィルターを通過したクラスターによって異なる場合があります。.
品質スコア†
| MiSeq試薬キット v2 | MiSeq試薬キット v3 |
|---|---|
| > 90%の塩基配列は、1×36 bpのQ30よりも高い | > 2×75 bpでQ30より高い85%塩基 |
| > 2 × 25 bpの条件下で、90%はQ30よりも塩基数が多くなる | > 2×300 bpの条件において、70%の塩基配列はQ30よりも高い |
| > 2×150 bpの条件において、80%の塩基配列はQ30よりも高い | |
| > 2 × 250 bp 条件で、Q30 よりも 75% の塩基数が多くなる |
† Qスコア(品質スコア)は、塩基コールのエラー確率を予測します。Q30を超える塩基の割合を、ラン全体で平均します。.
Nanopore MinIONとIllumina MiSeq 16S rRNA遺伝子シーケンシングの潜在能力に関する予備的研究
Illumina MiSeqでシーケンスされたショートリード増幅子とNanopore MinIONでシーケンスされたロングリード増幅子の両方を、GGおよびSILVAデータベースに対して分類学的に割り当てました。得られた微生物分類を、全12サンプルについて異なる分類学的レベル(科、属、種)で比較しました。.

含める
- 設置および運用適格性確認
- 使い捨て洗浄チューブ
- MiSeq試薬キット v3 (150サイクル)
- MiSeq試薬キット v3 (600サイクル)
- TG MiSeq試薬キット v3 (600サイクル)
- TG MiSeq®試薬キット v3 (150サイクル)
- 試薬キット v2 (50サイクル)
- 試薬キット v2 (300サイクル)
- 試薬キット v2 (500サイクル)
- OEMインストールおよび予防保全が実施されました。.
- 使用しないときは機械の電源を切ります。洗浄は毎月行います。すべてのソフトウェアが含まれています。.
参考リンク
















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