Sistema Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR

Bio Rad QX200 O Sistema Droplet Digital PCR (ddPCR) fornece quantificação absoluta de moléculas de DNA ou RNA alvo para aplicações de PCR digital baseadas em EvaGreen ou sonda. O BioRad QX200 combina a tecnologia de gotículas de emulsão água-óleo com microfluídica. O gerador de gotículas AutoDG particiona cada amostra em 20.000 gotículas uniformes de tamanho nanolítrico e um leitor de gotículas com software QuantaSoft™ agrupado conta as gotículas PCR-positivas e PCR-negativas.

Milhares de hospitais e laboratórios de testes moleculares nos EUA e em todo o mundo têm instalados os sistemas QX200 e QXDx ddPCR da Bio-Rad e dispõem da capacidade de realizar testes ddPCR de SARS-CoV-2. O teste ddPCR de SARS-CoV-2 representa a mais recente adição às ofertas de produtos da Bio-Rad relacionadas com a COVID-19. Esta é a segunda EUA concedida à Bio-Rad para a COVID-19. Na semana passada, a empresa recebeu uma Autorização de Uso de Emergência (EUA) para um teste sorológico para detetar anticorpos contra o vírus.

A Droplet Digital PCR (ddPCR) utiliza tecnologia avançada de microfluídica para gerar milhares de gotículas uniformes de tamanho nanolítrico em cada amostra, alcançando a partição da amostra em larga escala. Uma vez geradas, as gotículas podem ser amplificadas, lidas e analisadas. Na PCR tradicional, realiza-se uma única medição numa única amostra, enquanto na ddPCR, milhares de medições podem ser realizadas em cada amostra.

O ddPCR da Bio-Rad pode ser útil em muitas aplicações de qualidade e segurança alimentar/hídrica, como testes de OGM, deteção de alergénios, fraude alimentar, quantificação de vírus bacterianos e transmitidos por alimentos/água e perfil de virulência. Nesta área de aplicação, a tecnologia oferece todos os seus benefícios intrínsecos em termos de resolução na quantificação, possibilidade de colocalização de genes a nível de bactéria individual e sensibilidade reduzida a inibidores de PCR.

Sistema Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR. Sistema de PCR digital de quantificação de genes de ultra-sensibilidade e alta precisão

O Sistema Droplet DigitalTM PCR (ddPCRTM) é um PCR de terceira geração que acelera significativamente a investigação em doenças genéticas, cancro e doenças infeciosas.

O sistema ddPCR permite realizar quantificação absoluta com precisão e sensibilidade extremamente elevadas. Como pode ser analisado com uma resolução de 1 cópia, é útil para aplicações como análise de CNV (variação do número de cópias), deteção de sequências raras e análise da expressão génica.

Benefícios do Sistema QX200 Droplet Digital PCR

• A solução de PCR digital mais precisa e sensível para uma vasta gama de aplicações
• Química de PCR digital flexível — otimizada para ensaios com sonda de hidrólise TaqMan e EvaGreen
• Configuração flexível do ensaio — escalável para alta sensibilidade ou alto rendimento
• Fluxo de trabalho simples e fácil de usar com uma produtividade de 96 amostras
• A partição de gotículas pela tecnologia QX200 Droplet Digital reduz o viés da eficiência de amplificação e dos inibidores de PCR
• Desenho de ensaio conveniente — curvas de calibração não são necessárias

Aplicações do Sistema QX200 Droplet Digital PCR

• Estudos de biomarcadores de cancro e variação do número de cópias
  Meça graus variáveis de mutações de cancro, detete cópias raras de alvos de ADN e resolva estados de variação do número de cópias com sensibilidade e resolução superiores. Os Ensaios ddPCR PrimePCR™ estão agora disponíveis para deteção de mutações e número de cópias. Estes são ensaios pré-concebidos e validados em laboratório.
• Deteção de patógenos
  Utilize a precisão extrema do Sistema QX200 para quantificar pequenas alterações na quantidade de moléculas de ADN ou ARN alvo na deteção e monitorização de patogénios.
• Sequenciação de nova geração
  Realizar quantificação e qualificação precisas de bibliotecas NGS sem o uso de uma curva de calibração.
• Análise da expressão génica
  Obtenha medições fiáveis e reprodutíveis de pequenas alterações de expressão de mRNA e miRNA em baixas abundâncias.
• Monitorização ambiental 
  Teste uma vasta gama de amostras ambientais como solo e água utilizando o Sistema QX200.
• Análise alimentar 
  Efetuar a avaliação de rotina de organismos geneticamente modificados (OGM) utilizando métodos ddPCR validados.

O QX200 da Bio-Rad e o sistema QuantStudio™ 3D Digital PCR da Life Technologies ostentam 20.000 partições por amostra. O primeiro, com imagem de gotículas semelhante à citometria de fluxo, tem o potencial de isolar uma gotícula para análise adicional (uma funcionalidade que foi demonstrada na literatura publicada, mas que não está atualmente disponível na plataforma comercial), enquanto o QuantStudio 3D permite aos utilizadores reanalisar um chip se algo correr mal com a leitura inicial.

Tecnologia e Fluxo de Trabalho de PCR Digital Droplet

O Sistema QX200 Droplet Digital PCR da Bio-Rad consiste em dois instrumentos, o QX200 Droplet Generator e o QX200 Droplet Reader, e os seus consumíveis associados.

O Bio Rad QX200 Droplet Generator é usado para particionar a mistura de reações ddPCR em milhares de gotículas de tamanho nanolítrico. Após a PCR num termociclador, as gotículas de cada amostra são analisadas individualmente no QX200 Droplet Reader. As gotículas são lidas poço a poço à medida que são transmitidas em fila única por um sistema de deteção ótica a duas cores de forma serial.

Podem ser processadas até 96 amostras por execução. As gotas PCR-positivas e PCR-negativas são contadas para fornecer quantificação absoluta de ADN alvo em formato digital. Alternativamente, os produtos amplificados podem ser extraídos das gotas após a PCR para aplicações subsequentes, como sequenciação ou clonagem.

Incluir:

• Sistema Gerador de Gotículas QX200
• Sistema QX200 Droplet Reader
• notebook com análise dedicada
• Seladora de Placas PCR 1PX1

Link de Referência

• Informações do Fabricante
• Brochura