Système PCR numérique à gouttelettes Bio-Rad QX200

Bio Rad QX200 Le système Droplet Digital PCR (ddPCR) fournit une quantification absolue des molécules d'ADN ou d'ARN cibles pour les applications de PCR numérique basées sur EvaGreen ou des sondes. Le BioRad QX200 combine la technologie d'émulsion eau-huile en gouttelettes avec la microfluidique. Le générateur de gouttelettes AutoDG partitionne chaque échantillon en 20 000 gouttelettes uniformes de taille nanolitre et un lecteur de gouttelettes associé au logiciel QuantaSoft™ compte les gouttelettes PCR positives et PCR négatives.

Des milliers d'hôpitaux et de laboratoires de tests moléculaires aux États-Unis et dans le monde ont installé les systèmes QX200 et QXDx ddPCR de Bio-Rad et ont la capacité de réaliser des tests ddPCR pour le SARS-CoV-2. Le test ddPCR pour le SARS-CoV-2 représente le dernier ajout à l'offre de produits de Bio-Rad relatifs au COVID-19. Il s'agit de la deuxième autorisation d'utilisation d'urgence (EUA) que Bio-Rad a obtenue pour le COVID-19. La semaine dernière, l'entreprise reçu une autorisation d'utilisation d'urgence pour un test sérologique pour détecter les anticorps contre le virus.

La technologie Droplet Digital PCR (ddPCR) utilise une technologie microfluidique avancée pour générer des milliers de gouttelettes uniformes de taille nanolitre dans chaque échantillon, réalisant ainsi un partitionnement d'échantillons à très grande échelle. Une fois générées, les gouttelettes peuvent être amplifiées, lues et analysées. Dans la PCR traditionnelle, une seule mesure est effectuée sur un seul échantillon, tandis que dans la ddPCR, des milliers de mesures peuvent être effectuées sur chaque échantillon.

Le ddPCR de Bio-Rad peut être utile pour de nombreuses applications de qualité et de sécurité alimentaire/hydrique telles que le test des OGM, la détection d'allergènes, la fraude alimentaire, la numération de bactéries et de virus d'origine alimentaire/hydrique, et le profilage de virulence. Dans ce domaine d'application, la technologie offre tous ses avantages intrinsèques en termes de résolution dans la quantification, la possibilité de colocalisation des gènes au niveau d'une seule bactérie et une sensibilité réduite aux inhibiteurs de PCR.

Système QX200 Droplet Digital PCR de Bio-Rad. Système de PCR numérique de quantification génique ultra-sensible et de haute précision

Le système Droplet DigitalTM PCR (ddPCRTM) est une PCR de troisième génération qui accélère considérablement la recherche sur les maladies génétiques, le cancer et les maladies infectieuses.

Le système ddPCR peut effectuer une quantification absolue avec une précision et une sensibilité extrêmement élevées. Comme il peut être analysé à une résolution d'une copie, il est utile pour des applications telles que l'analyse des variations du nombre de copies (CNV), la détection de séquences rares et l'analyse de l'expression des gènes.

Avantages du système QX200 Droplet Digital PCR

• La solution de PCR numérique la plus précise et la plus sensible pour une large gamme d'applications
• Chimie PCR numérique flexible — optimisée pour les sondes d'hydrolyse TaqMan et les dosages EvaGreen
• Configuration d'essai flexible — évolutive pour une haute sensibilité ou un haut débit
• Flux de travail simple et facile à utiliser avec un débit de 96 échantillons
• Le partitionnement des gouttelettes par la technologie numérique de gouttelettes QX200 réduit les biais dus à l'efficacité d'amplification et aux inhibiteurs de PCR
• Conception d'essais pratique — les courbes standard ne sont pas nécessaires

Applications du système QX200 Droplet Digital PCR

• Biomarqueurs du cancer et variation du nombre de copies
  Mesurez des degrés variables de mutations cancéreuses, détectez de rares copies d'ADN cibles et résolvez les états de variation du nombre de copies avec une sensibilité et une résolution supérieures. Les tests PrimePCR™ ddPCR sont maintenant disponibles pour la détection de mutations et du nombre de copies. Ce sont des tests prédéfinis et validés en laboratoire humide.
• Détection des agents pathogènes
  Exploitez la précision extrême du système QX200 pour quantifier de faibles changements d'expression de molécules d'ADN ou d'ARN cibles dans la détection et la surveillance des pathogènes.
• Séquençage de nouvelle génération
  Effectuer une quantification et une qualification précises des bibliothèques NGS sans utiliser de courbe d'étalonnage.
• Analyse de l'expression génique
  Atteindre des mesures fiables et reproductibles de petits changements d'expression pour de faibles abondances d'ARNm et de microARN.
• Surveillance environnementale 
  Testez une grande variété d'échantillons environnementaux comme le sol et l'eau à l'aide du système QX200.
• Tests alimentaires 
  Effectuer une évaluation de routine des organismes génétiquement modifiés (OGM) à l'aide de méthodes ddPCR validées.

Le QX200 de Bio-Rad et le système QuantStudio™ 3D Digital PCR de Life Technologies disposent chacun de 20 000 partitions par échantillon. Le premier, avec une imagerie des gouttelettes de type cytométrie en flux, a le potentiel d'isoler une gouttelette pour une analyse plus poussée (une fonctionnalité qui a été démontrée dans la littérature publiée mais qui n'est pas actuellement proposée sur la plateforme commerciale), tandis que le QuantStudio 3D permet aux utilisateurs de réanalyser une puce si quelque chose se passe mal lors de la lecture initiale.

Technologie et flux de travail du dPCR en gouttelettes

Le système Droplet Digital PCR QX200 de Bio-Rad se compose de deux instruments, le Générateur de gouttelettes QX200 et le Lecteur de gouttelettes QX200, ainsi que de leurs consommables associés.

Le générateur de gouttelettes QX200 de Bio-Rad est utilisé pour partitionner le mélange de réaction ddPCR en milliers de gouttelettes de taille nanoliter. Après PCR sur un thermocycleur, les gouttelettes de chaque échantillon sont analysées individuellement sur le lecteur de gouttelettes QX200. Les gouttelettes sont lues puits par puits tandis qu'elles défilent, une par une, devant un système de détection optique bicolore de manière sérielle.

Jusqu'à 96 échantillons peuvent être traités par cycle. Les gouttelettes PCR positives et PCR négatives sont comptées pour fournir une quantification absolue de l'ADN cible sous forme numérique. Alternativement, les produits amplifiés peuvent être extraits des gouttelettes après PCR pour des applications en aval, telles que le séquençage ou le clonage.

Inclure :

• Système de générateur de gouttelettes QX200
• Système QX200 Droplet Reader
• ordinateur portable d'analyse dédié
• Scelleuse de plaques PCR 1PX1

Lien de référence

• Informations sur le fabricant
• Brochure