Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR System

Bio Rad QX200 Das Droplet Digital PCR (ddPCR) System bietet eine absolute Quantifizierung von Ziel-DNA- oder -RNA-Molekülen für digitale PCR-Anwendungen basierend auf EvaGreen oder Sonden. Das BioRad QX200 kombiniert Wasser-in-Öl-Emulsionströpfchentechnologie mit Mikrofluidik. Der AutoDG-Tröpfchengenerator teilt jede Probe in 20.000 gleichmäßige Tröpfchen im Nanoliter-Bereich auf, und ein Tröpfchenleser in Verbindung mit der QuantaSoft™-Software zählt die PCR-positiven und PCR-negativen Tröpfchen.

Tausende von Krankenhäusern und molekularen Testlaboren in den USA und auf der ganzen Welt verfügen über installierte QX200 und QXDx ddPCR-Systeme von Bio-Rad und haben die Kapazität, SARS-CoV-2 ddPCR-Tests durchzuführen. Der SARS-CoV-2 ddPCR-Test stellt die neueste Ergänzung des Produktangebots von Bio-Rad im Zusammenhang mit COVID-19 dar. Dies ist die zweite EUA, die Bio-Rad für COVID-19 erhalten hat. Letzte Woche hat das Unternehmen eine Zulassung für einen Serologietest erhalten hat Antikörper gegen das Virus nachzuweisen.

Droplet Digital PCR (ddPCR) nutzt fortschrittliche Mikrofluidik-Technologie, um Tausende von hochgradig einheitlichen Nanoliter-großen Tröpfchen in jeder Probe zu erzeugen und so eine massive Aufteilung der Probe zu erreichen. Nach der Erzeugung können die Tröpfchen amplifiziert, ausgelesen und analysiert werden. Während bei der traditionellen PCR eine einzelne Messung an einer einzelnen Probe durchgeführt wird, können bei ddPCR Tausende von Messungen an jeder Probe durchgeführt werden.

Bio-Rad ddPCR kann für viele Anwendungen in den Bereichen Lebensmittel-/Wasserqualität und -sicherheit nützlich sein, wie z. B. GMO-Tests, Allergenerkennung, Lebensmittelbetrug, Zählung von Bakterien und Lebensmitteln/Wasser, die durch Viren übertragen werden, sowie Virulenzprofilierung. In diesem Anwendungsbereich bietet die Technologie alle ihre inhärenten Vorteile in Bezug auf Auflösung, Quantifizierungsmöglichkeit der Genlokalisierung auf der Ebene einzelner Bakterien und reduzierte Empfindlichkeit gegenüber PCR-Inhibitoren.

Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR System. Hochsensibles und hochpräzises Genquantifizierungs-Digital-PCR-System

Das Droplet DigitalTM PCR System (ddPCRTM) ist eine PCR der dritten Generation, die die Forschung zu genetischen Krankheiten, Krebs und Infektionskrankheiten stark beschleunigt.

Das ddPCR-System kann eine absolute Quantifizierung mit extrem hoher Genauigkeit und Empfindlichkeit durchführen. Da es mit einer Auflösung von 1 Kopie analysiert werden kann, ist es nützlich für Anwendungen wie die CNV-Analyse (Copy Number Variation), die Detektion seltener Sequenzen und die Genexpressionsanalyse.

Vorteile des QX200 Droplet Digital PCR Systems

• Präziseste und empfindlichste digitale PCR-Lösung für eine Vielzahl von Anwendungen
• Flexible digitale PCR-Chemie — optimiert für TaqMan-Hydrolysesonden und EvaGreen-Assays
• Flexible Assay-Einrichtung — skalierbar für hohe Empfindlichkeit oder hohen Durchsatz
• Einfacher und benutzerfreundlicher Workflow mit einem Durchsatz von 96 Proben
• Die Tröpfchenteilung mittels der QX200 Droplet Digital Technologie reduziert Verzerrungen durch Amplifikationseffizienz und PCR-Inhibitoren
• Bequemes Assay-Design — Standardkurven sind nicht erforderlich

Anwendungen des QX200 Droplet Digital PCR Systems

• Krebsbiomarkerstudien und Genomkopienzahlvariationen
  Messen Sie unterschiedliche Grade von Krebsmutationen, erkennen Sie seltene DNA-Zielkopien und lösen Sie Kopienzahlvariantenzustände mit überlegener Empfindlichkeit und Auflösung. PrimePCR™ ddPCR Assays sind jetzt für die Mutations- und Kopienzahl-Detektion verfügbar. Dies sind vordesignte, im Labor validierte Assays.
• Pathogendetektion
  Nutzen Sie die extreme Präzision des QX200 Systems, um geringe Änderungen der Ziel-DNA- oder RNA-Moleküle bei der Erregererkennung und -überwachung zu quantifizieren.
• Next-Generation-Sequenzierung
  Führen Sie eine genaue Quantifizierung und Qualifizierung von NGS-Bibliotheken ohne Verwendung einer Standardkurve durch.
• Genexpressionsanalyse
  Erreichen Sie zuverlässige und reproduzierbare Messungen kleiner Faltungsänderungen bei geringer mRNA- und miRNA-Abundanz.
• Umweltüberwachung 
  Testen Sie eine Vielzahl von Umweltproben wie Boden und Wasser mit dem QX200 System.
• Lebensmittelprüfung 
  Führen Sie die routinemäßige Bewertung gentechnisch veränderter Organismen (GVO) mithilfe validierter ddPCR-Methoden durch.

Das Bio-Rad-QX200 und das QuantStudio™ 3D Digital PCR System von Life Technologies verfügen jeweils über 20.000 Partitionen pro Probe. Ersteres, mit einem Durchflusszytometrie-ähnlichen Imaging von Tröpfchen, hat das Potenzial, ein Tröpfchen für eine weitere Analyse zu isolieren (eine Funktion, die in der veröffentlichten Literatur nachgewiesen wurde, aber derzeit nicht auf der kommerziellen Plattform angeboten wird), während das QuantStudio 3D es den Benutzern ermöglicht, einen Chip neu zu analysieren, wenn bei der anfänglichen Auslesung etwas schiefgeht.

Droplet Digital PCR Technologie und Workflow

Das Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR System besteht aus zwei Instrumenten, dem QX200 Droplet Generator und dem QX200 Droplet Reader, sowie den dazugehörigen Verbrauchsmaterialien.

Der Bio-Rad-QX200-Tröpfchengenerator wird verwendet, um die ddPCR-Reaktionsmischung in Tausende von Tröpfchen im Nanoliter-Format aufzuteilen. Nach der PCR in einem Thermocycler werden die Tröpfchen jeder Probe einzeln auf dem QX200-Tröpfchenleser analysiert. Die Tröpfchen werden Well-für-Well gelesen, während sie in einer Reihe einzeln an einem zweifarbigen optischen Detektionssystem vorbeiströmen.

Pro Lauf können bis zu 96 Proben verarbeitet werden. Die PCR-positiven und PCR-negativen Tröpfchen werden gezählt, um eine absolute Quantifizierung der Ziel-DNA in digitaler Form zu ermöglichen. Alternativ können die amplifizierten Produkte nach der PCR aus den Tröpfchen extrahiert und für nachgeschaltete Anwendungen wie Sequenzierung oder Klonierung verwendet werden.

Einfügen:

• QX200 Tröpfchengenerator-System
• QX200 Tröpfchenleser-System
• dediziertes Analyse-Notebook-PC
• 1PX1 PCR-Plattenversiegelung

Referenzlink

• Herstellerinformationen
• Broschüre